MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl23

Total Repeats: 505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011257	AAT	2	6	618	623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288798
2	NC_011257	T	6	6	633	638	0 %	100 %	0 %	0 %	203288798
3	NC_011257	TTA	2	6	664	669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288798
4	NC_011257	AAT	3	9	674	682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288798
5	NC_011257	CAAA	2	8	691	698	75 %	0 %	0 %	25 %	203288798
6	NC_011257	AT	3	6	711	716	50 %	50 %	0 %	0 %	203288798
7	NC_011257	CTC	2	6	735	740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288798
8	NC_011257	A	8	8	771	778	100 %	0 %	0 %	0 %	203288798
9	NC_011257	ATAA	2	8	786	793	75 %	25 %	0 %	0 %	203288798
10	NC_011257	T	7	7	801	807	0 %	100 %	0 %	0 %	203288798
11	NC_011257	TTCAT	2	10	831	840	20 %	60 %	0 %	20 %	203288798
12	NC_011257	AC	3	6	873	878	50 %	0 %	0 %	50 %	203288798
13	NC_011257	ACA	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288799
14	NC_011257	TCA	2	6	1340	1345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288799
15	NC_011257	A	7	7	1377	1383	100 %	0 %	0 %	0 %	203288799
16	NC_011257	A	7	7	1430	1436	100 %	0 %	0 %	0 %	203288799
17	NC_011257	ATT	2	6	1477	1482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288799
18	NC_011257	CATA	2	8	1498	1505	50 %	25 %	0 %	25 %	203288799
19	NC_011257	T	7	7	1546	1552	0 %	100 %	0 %	0 %	203288799
20	NC_011257	GAA	2	6	1553	1558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288799
21	NC_011257	CATA	2	8	1590	1597	50 %	25 %	0 %	25 %	203288799
22	NC_011257	CAG	2	6	1602	1607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288799
23	NC_011257	ATTA	2	8	1630	1637	50 %	50 %	0 %	0 %	203288799
24	NC_011257	AAC	2	6	1645	1650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288799
25	NC_011257	CAA	2	6	1653	1658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288799
26	NC_011257	GTT	2	6	1725	1730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288799
27	NC_011257	AAT	2	6	1770	1775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288799
28	NC_011257	CAA	2	6	1797	1802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288799
29	NC_011257	TAT	2	6	1803	1808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288799
30	NC_011257	AAG	2	6	1936	1941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288799
31	NC_011257	TAA	2	6	1974	1979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288799
32	NC_011257	ATC	2	6	1999	2004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288799
33	NC_011257	CAT	2	6	2022	2027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288799
34	NC_011257	ATT	2	6	2056	2061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288799
35	NC_011257	ACA	2	6	2102	2107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288799
36	NC_011257	AAT	2	6	2213	2218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288799
37	NC_011257	CAT	2	6	2226	2231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288799
38	NC_011257	TCC	2	6	2250	2255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288799
39	NC_011257	CAT	2	6	2558	2563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288800
40	NC_011257	ATG	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288800
41	NC_011257	TC	3	6	2614	2619	0 %	50 %	0 %	50 %	203288800
42	NC_011257	ATCCC	2	10	2651	2660	20 %	20 %	0 %	60 %	203288800
43	NC_011257	AGC	2	6	2808	2813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288800
44	NC_011257	ATC	2	6	2908	2913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288800
45	NC_011257	GCA	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288800
46	NC_011257	ACC	2	6	2967	2972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288800
47	NC_011257	CAT	2	6	3017	3022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288800
48	NC_011257	TTG	2	6	3065	3070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288800
49	NC_011257	CTT	2	6	3140	3145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288800
50	NC_011257	TAG	2	6	3221	3226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288800
51	NC_011257	CAA	3	9	3245	3253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288800
52	NC_011257	AACATC	2	12	3255	3266	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	203288800
53	NC_011257	TTC	2	6	3279	3284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288800
54	NC_011257	TCAT	2	8	3340	3347	25 %	50 %	0 %	25 %	203288800
55	NC_011257	TTA	2	6	3407	3412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288800
56	NC_011257	TCA	2	6	3433	3438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288800
57	NC_011257	TAAA	2	8	3467	3474	75 %	25 %	0 %	0 %	203288800
58	NC_011257	TCT	2	6	3502	3507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288800
59	NC_011257	TAAT	2	8	3515	3522	50 %	50 %	0 %	0 %	203288800
60	NC_011257	T	6	6	3522	3527	0 %	100 %	0 %	0 %	203288800
61	NC_011257	ATC	2	6	3555	3560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288800
62	NC_011257	TAA	2	6	3695	3700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288800
63	NC_011257	GAT	2	6	3722	3727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288800
64	NC_011257	CCTT	2	8	3799	3806	0 %	50 %	0 %	50 %	203288800
65	NC_011257	A	6	6	3859	3864	100 %	0 %	0 %	0 %	203288800
66	NC_011257	AT	4	8	3876	3883	50 %	50 %	0 %	0 %	203288800
67	NC_011257	GAT	2	6	3928	3933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288800
68	NC_011257	CAT	2	6	3953	3958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288800
69	NC_011257	CTT	2	6	3971	3976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288800
70	NC_011257	ATT	2	6	3995	4000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288800
71	NC_011257	A	6	6	5120	5125	100 %	0 %	0 %	0 %	203288801
72	NC_011257	AC	3	6	5182	5187	50 %	0 %	0 %	50 %	203288801
73	NC_011257	A	6	6	5200	5205	100 %	0 %	0 %	0 %	203288801
74	NC_011257	CTATA	2	10	5230	5239	40 %	40 %	0 %	20 %	203288801
75	NC_011257	ATA	2	6	5257	5262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288801
76	NC_011257	A	6	6	5265	5270	100 %	0 %	0 %	0 %	203288801
77	NC_011257	T	6	6	5307	5312	0 %	100 %	0 %	0 %	203288801
78	NC_011257	A	6	6	5327	5332	100 %	0 %	0 %	0 %	203288801
79	NC_011257	AT	3	6	5339	5344	50 %	50 %	0 %	0 %	203288801
80	NC_011257	AGC	2	6	5348	5353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288801
81	NC_011257	CAA	2	6	5377	5382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288801
82	NC_011257	A	6	6	5393	5398	100 %	0 %	0 %	0 %	203288801
83	NC_011257	ATAA	2	8	5409	5416	75 %	25 %	0 %	0 %	203288801
84	NC_011257	AAC	2	6	5426	5431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288801
85	NC_011257	CCTC	2	8	5451	5458	0 %	25 %	0 %	75 %	203288801
86	NC_011257	GTAG	2	8	5483	5490	25 %	25 %	50 %	0 %	203288801
87	NC_011257	TAA	2	6	5543	5548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288801
88	NC_011257	TTA	2	6	5553	5558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288801
89	NC_011257	AAAT	2	8	5633	5640	75 %	25 %	0 %	0 %	203288801
90	NC_011257	ATA	2	6	5647	5652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288801
91	NC_011257	AAAT	2	8	5653	5660	75 %	25 %	0 %	0 %	203288801
92	NC_011257	TAAAAC	2	12	5665	5676	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203288801
93	NC_011257	TTA	2	6	5715	5720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288801
94	NC_011257	A	6	6	5748	5753	100 %	0 %	0 %	0 %	203288801
95	NC_011257	AGC	2	6	5783	5788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288801
96	NC_011257	TCA	2	6	5860	5865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288801
97	NC_011257	AAT	2	6	5891	5896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288801
98	NC_011257	GTAA	2	8	5907	5914	50 %	25 %	25 %	0 %	203288801
99	NC_011257	ATA	2	6	5928	5933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288801
100	NC_011257	CCAA	2	8	5943	5950	50 %	0 %	0 %	50 %	203288801
101	NC_011257	AATA	2	8	6002	6009	75 %	25 %	0 %	0 %	203288801
102	NC_011257	ATA	2	6	6102	6107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288801
103	NC_011257	ATTC	2	8	6149	6156	25 %	50 %	0 %	25 %	203288801
104	NC_011257	ACA	2	6	6162	6167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288801
105	NC_011257	A	6	6	6176	6181	100 %	0 %	0 %	0 %	203288801
106	NC_011257	GA	3	6	6307	6312	50 %	0 %	50 %	0 %	203288801
107	NC_011257	TA	3	6	6314	6319	50 %	50 %	0 %	0 %	203288801
108	NC_011257	AAC	2	6	6326	6331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288801
109	NC_011257	TAT	2	6	6332	6337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288801
110	NC_011257	AT	3	6	6336	6341	50 %	50 %	0 %	0 %	203288801
111	NC_011257	TAT	2	6	6397	6402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288801
112	NC_011257	ATT	2	6	6428	6433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288801
113	NC_011257	TTA	2	6	6574	6579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288802
114	NC_011257	ATT	2	6	6609	6614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288802
115	NC_011257	A	6	6	6617	6622	100 %	0 %	0 %	0 %	203288802
116	NC_011257	TAA	2	6	6656	6661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288802
117	NC_011257	A	6	6	6660	6665	100 %	0 %	0 %	0 %	203288802
118	NC_011257	T	7	7	6666	6672	0 %	100 %	0 %	0 %	203288802
119	NC_011257	TAA	2	6	6677	6682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288802
120	NC_011257	A	7	7	6723	6729	100 %	0 %	0 %	0 %	203288802
121	NC_011257	TAAA	2	8	6767	6774	75 %	25 %	0 %	0 %	203288802
122	NC_011257	CTA	2	6	6782	6787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288802
123	NC_011257	AAT	2	6	6854	6859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288802
124	NC_011257	TAT	2	6	6875	6880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288802
125	NC_011257	AT	3	6	6898	6903	50 %	50 %	0 %	0 %	203288802
126	NC_011257	A	7	7	6976	6982	100 %	0 %	0 %	0 %	203288802
127	NC_011257	TAA	2	6	6990	6995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288802
128	NC_011257	TAA	2	6	7007	7012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288802
129	NC_011257	TAT	2	6	7059	7064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288803
130	NC_011257	ATT	2	6	7070	7075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288803
131	NC_011257	CTA	2	6	7101	7106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288803
132	NC_011257	CAT	2	6	7135	7140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288803
133	NC_011257	AAATCT	2	12	7265	7276	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	203288803
134	NC_011257	AAT	2	6	7342	7347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288803
135	NC_011257	ATT	2	6	7406	7411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288803
136	NC_011257	CT	3	6	7476	7481	0 %	50 %	0 %	50 %	203288803
137	NC_011257	T	6	6	7493	7498	0 %	100 %	0 %	0 %	203288803
138	NC_011257	A	10	10	7534	7543	100 %	0 %	0 %	0 %	203288803
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405	NC_011257	TAA	2	6	17865	17870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288814
406	NC_011257	TAAC	2	8	17988	17995	50 %	25 %	0 %	25 %	203288814
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